Sabado, 24 de septiembre de 2022

I+D12 de enero, 2022

Una nueva estrategia de medicina genómica mejora el diagnóstico de las leucodistrofias y permite descubrir nuevos genes vinculados

Grupo de Enfermedades Neurometabólicas del IDIBELL y el Ciberer. Grupo de Enfermedades Neurometabólicas del IDIBELL y el Ciberer.

Las leucodistrofias son un grupo heterogéneo de enfermedades raras de origen genético difíciles de diagnosticar.

Ciberer

Una nueva estrategia de medicina genómica mejora la tasa diagnóstica de las leucodistrofias, además de permitir el descubrimiento de nuevos genes causantes de estas enfermedades y ampliar los cuadros clínicos descritos. Las leucodistrofias son un grupo heterogéneo de enfermedades raras de origen genético que afectan a la mielina, la substancia blanca del cerebro. Hasta el momento, se han identificado más de 100 genes causantes de estas patologías, con una prevalencia de 1 de cada 7.000 nacimientos. Con las aproximaciones actuales, se obtiene el diagnóstico molecular solo en la mitad de los pacientes.

El estudio, en el que han participado departamentos de neurología pediátricos y de adultos de diversos hospitales terciarios españoles, ha sido liderado por Aurora Pujol, médico genetista y profesora ICREA en el Institut d’Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL) y el Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Raras (Ciberer).

Algortimo computacional 

La estrategia utilizada combina el análisis de exomas y genomas mediante un algoritmo computacional –un primer paso a la inteligencia artificial– que utiliza los datos clínicos de los pacientes para generar redes de interactomas (las interacciones moleculares entre las proteínas) y priorizar variantes. También realiza estudios funcionales en células derivadas de los pacientes para confirmar variantes de significado incierto. Además, intervienen los neurólogos en todo el proceso, desde la descripción exhaustiva del caso a la selección de variantes.

La estrategia utilizada combina el análisis de exomas y genomas mediante un algoritmo computacionalm un primer paso a la inteligencia artificial.

“El trabajo en equipo multidisciplinar es necesario para llegar al éxito en la mayoría de los casos y somos afortunados de contar con la implicación de los clínicos y los excelentes servicios de secuenciación del Centro Nacional de Análisis Genómicos (CNAG)”, comenta la doctora Pujol.

Los autores de este trabajo, publicado en la revista Neurology, han realizado un análisis de 126 pacientes con leucodistrofias de diferentes edades que no habían sido diagnosticados con los estudios clínicos y moleculares actuales, incluyendo paneles de genes NGS o exomas clínicos, y han alcanzado una tasa diagnóstica del 72%. Además, han identificado nuevos fenotipos, 9 nuevos genes causantes de leucodistrofias y varios genes mutados que contribuyen al cuadro clínico en 5 familias.

Heterogeneidad genética

Este estudio confirma la gran heterogeneidad genética de las leucodistrofias, con 57 genes identificados en los 91 casos diagnosticados. Además, muchos de estos genes no están asociados con el concepto clásico de las leucodistrofias, por lo que no estaban incluidos en los paneles NGS que se utilizan actualmente para su diagnóstico.

“Con nuestro análisis, hemos conseguido llegar al diagnóstico en seis meses de media, un gran avance en comparación con la odisea diagnóstica previa de estos casos, que se alargaba una media de 10 años".

“Con nuestro análisis, hemos conseguido llegar al diagnóstico en seis meses de media, un gran avance en comparación con la odisea diagnóstica previa de estos casos, que se alargaba una media de 10 años. Mas allá de permitir el consejo genético de estas familias, el diagnóstico molecular ha mejorado el manejo clínico del 32% de los pacientes. En algunos casos, hemos podido incluso empezar a testar opciones terapéuticas”, destaca la doctora Pujol. “Además –continúa–, hemos ampliado el conocimiento científico sobre funciones básicas del cerebro al poder identificar la causa genética de nuevos síndromes no descritos hasta la fecha. Por todo ello, proponemos un cambio de paradigma diagnóstico para aplicar el exoma completo (WES), o mejor la secuenciación del genoma (WGS) como test de elección con mejor relación coste/ eficiencia en la mayoría de casos de leucodistrofia”.




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