Viernes, 12 de agosto de 2022

I+D30 de julio, 2022

Un estudio del CSIC identifica diferencias desconocidas entre países en la transmisión de la tuberculosis

tuberculosis La epidemiología genómica se puede aplicar tanto para el diagnóstico como para la vigilancia de enfermedades infecciosas.

El trabajo analizó el genoma de una muestra de casos de esta patología en la Comunidad Valenciana entre 2014 y 2016.

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Un estudio liderado por el Instituto de Biomedicina de Valencia (IBV), del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), ha mostrado que la Comunidad Valenciana presenta una alta tasa de transmisión de la tuberculosis, significativamente mayor entre la población local, al contrario de lo que ocurre en países como Reino Unido o Países Bajos.

En el trabajo de investigación, en el que han participado la mayoría de los hospitales de esta comunidad autónoma y la Dirección General de Salud Pública, se analizó el genoma de una amplia muestra de los 1.388 casos de tuberculosis declarados en esta región durante el periodo 2014-2016. El trabajo, publicado en la revista eLife, identifica casos no detectados por el estudio convencional de contactos, contribuyendo así a complementar los esfuerzos para el control local de la transmisión.

En el trabajo de investigación, se analizó el genoma de una amplia muestra de los 1.388 casos de tuberculosis declarados en esta región.

Casos de tuberculosis

La tuberculosis es una enfermedad infecciosa causada por micobacterias del complejo Mycobacterium tuberculosis. En 2020 murieron de tuberculosis un total de 1,5 millones de personas, siendo la decimotercera causa de muerte y la enfermedad infecciosa más mortífera por detrás de la COVID-19, según datos de la Organización Mundial de la Salud. Se trata de una enfermedad de declaración obligatoria, es decir, los hospitales deben informar a las autoridades sanitarias de los nuevos casos diagnosticados.

En 2020 murieron de tuberculosis un total de 1,5 millones de personas, siendo la decimotercera causa de muerte y la enfermedad infecciosa más mortífera por detrás de la COVID-19.

En la Comunidad Valenciana la incidencia de la enfermedad se considera baja (8,4 casos por cada 100.000 habitantes), pero más del 60% de los contagios se da entre población de origen local, según el estudio publicado en eLife.

Este estudio forma parte de un proyecto desarrollado por la Unidad de Genómica de la Tuberculosis del Instituto de Biomedicina de Valencia, en colaboración con la Dirección General de Salud Pública (DGSP) de la Conselleria de Sanitat Universal i Salut Pública y los servicios de microbiología clínica de los hospitales de la Comunitat Valenciana; como parte del sistema de vigilancia de la tuberculosis. En él se analizaron 785 muestras del genoma de las micobacterias causantes de los 1.388 casos de tuberculosis en la Comunitat Valenciana entre 2014 y 2016, 1.092 con cultivo positivo.

Las muestras clínicas para el diagnóstico de la tuberculosis son procesadas en los hospitales valencianos. Los aislados de aquellas que presentan crecimiento micobacteriano son enviados al Laboratorio de Bioseguridad de la Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunitat Valenciana (FIisabio), donde se extrae el ADN de las micobacterias y se envía el IBV-CSIC para ser secuenciado. Esta información permite comparar los genomas de las distintas micobacterias y establecer similitudes entre ellos.

“Cuando las micobacterias tomadas de distintos pacientes tienen genomas idénticos o muy parecidos, hay una alta posibilidad de que exista un vínculo de transmisión o contagio entre ambos pacientes".

“Cuando las micobacterias tomadas de distintos pacientes tienen genomas idénticos o muy parecidos, hay una alta posibilidad de que exista un vínculo de transmisión o contagio entre ambos pacientes. De esta manera podemos medir la tasa de transmisión que hay en el área de estudio”, explica Mariana Gabriela López, investigadora del IBV-CSIC participante en el estudio.

Además, mediante las avanzadas técnicas de epidemiología genómica empleadas pueden conocer los linajes de micobacterias que causan la tuberculosis en la Comunitat Valenciana, estudiar si existen resistencias a los antibióticos que se utilizan en el tratamiento, evaluar la tasa de transmisión y saber si hay factores de riesgo asociados a la transmisión, entre otras cuestiones.

La epidemiología genómica combina la epidemiología clásica con la secuenciación de genomas completos.

La epidemiología genómica combina la epidemiología clásica con la secuenciación de genomas completos. Estas técnicas cobraron especial relevancia durante la pandemia de covid-19, donde el equipo del IBV-CSIC liderado por Iñaki Comas realizó los primeros estudios epidemiológicos del virus SARS-CoV-2 en España. La epidemiología genómica se puede aplicar tanto para el diagnóstico como para la vigilancia de enfermedades infecciosas con resultados que complementan las aproximaciones convencionales, permitiendo identificar vías de transmisión con mayor precisión. La pandemia de covid-19 es fundamental para definir estrategias de salud pública dirigidas a controlar y reducir la transmisión del virus.

Tasas de transmisión

Entre los principales resultados que arroja el estudio está la alta tasa de transmisión de tuberculosis que presenta la esta comunidad, significativamente mayor entre la población local y comparable con la observada en países de alta incidencia de la enfermedad como India, China, Indonesia o Filipinas. “Además, no encontramos factores de riesgo asociados a la transmisión, es decir, no hemos encontrado ningún hábito o enfermedad que explique la elevada tasa de transmisión observada”, revela Mariana Gabriela López.

Por otra parte, sus datos permiten detectar un gran número de casos de transmisión adicionales a los detectados por el sistema de rastreo de contactos de esta comunidad. El equipo de investigación cree que esta información permitirá mejorar los sistemas de vigilancia y control de la tuberculosis. De hecho, la combinación de la vigilancia convencional con la información genómica ya ha sido usada para resolver brotes de especial dificultad.

El estudio confirma décadas de transmisión ininterrumpida de la tuberculosis en la Comunidad Valenciana, reflejando las altas tasas de incidencia que tuvo la enfermedad en el pasado.

Por último, el estudio confirma décadas de transmisión ininterrumpida de la tuberculosis en la Comunidad Valenciana, reflejando las altas tasas de incidencia que tuvo la enfermedad en el pasado y los problemas para identificar dónde se produce la transmisión en el presente.

Control global 

El estudio también compara el perfil de la tuberculosis en la Comunidad Valenciana con un país de baja incidencia (Reino Unido) y otro de alta (Malawi). La transmisión en la Comunidad se sitúa a medio camino entre los dos países. Esto indica que la naturaleza de la epidemia puede ser muy diferente incluso entre países con una tasa similar de casos.

La transmisión en la Comunidad se sitúa a medio camino entre los dos países.

Como indica el investigador del IBV-CSIC, Iñaki Comas, “para mejorar el control global de la tuberculosis debemos transitar desde una situación que trata por igual a todos los países a una en la que se caracterice en detalle la naturaleza de la epidemia en cada país para poder adaptar las herramientas de control. Con este estudio, la Comunidad Valenciana es una de las pocas zonas del mundo con una caracterización tan detallada”, asegura Comas que también es coordinador de la Plataforma de Salud Global del CSIC.




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